As Doenças Infecciosas, ou Infeciologia, é uma especialidade médica que se dedica à prevenção, diagnóstico e tratamento de infeções causadas por microorganismos, sejam eles bactérias, vírus, protozoários ou fungos. Nesta especialidade está ainda integrada a Consulta do Viajante, que tem como objetivo prestar aconselhamento sobre os riscos para a saúde inerentes às viagens, atuando ao nível da prevenção, mas também no diagnóstico e tratamento de doenças infecciosas, bem como de outras ocorrências que podem surgir no decurso dessas viagens.

Na CUF, a Infeciologia exerce a sua atividade em colaboração próxima com o Laboratório, com a Patologia Clínica, com a Dermatologia, com a Medicina Interna e com a Pediatria, entre outras especialidades.